安徽中醫(yī)藥大學重點學科為中醫(yī)肺病學、中醫(yī)基礎理論、中醫(yī)生物學、中醫(yī)內(nèi)分泌科、針刺、藥用植物學、中醫(yī)史、中醫(yī)潰瘍病、中醫(yī)保健、中醫(yī)老年病學、中藥化學、臨床中藥學、中西醫(yī)結(jié)合診所、中醫(yī)信息學、中醫(yī)傳染病、中醫(yī)“未病先治”研究、中醫(yī)文化、中醫(yī)等，以下為具體名單，以供參考，可調(diào)整的，以學校最新公告為準。
安徽中醫(yī)藥大學重點學科名單
序號 | 學科名稱 | 學科級別 |
1 | 中醫(yī)肺病學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
2 | 中醫(yī)基礎理論 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
3 | 中醫(yī)痹病學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
4 | 中醫(yī)內(nèi)分泌病學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
5 | 針灸學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
6 | 藥用植物學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
7 | 中醫(yī)史學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
8 | 中醫(yī)瘡瘍病學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
9 | 中醫(yī)養(yǎng)生學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
10 | 中醫(yī)老年病學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
11 | 中藥化學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
12 | 臨床中藥學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
13 | 中西醫(yī)結(jié)合臨床 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
14 | 中醫(yī)藥信息學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
15 | 中醫(yī)傳染病學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
16 | 中醫(yī)“治未病”學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
17 | 中醫(yī)文化學 | 國家中醫(yī)藥重點學科 |
18 | 中醫(yī)學 | 安徽省重點學科（A類） 安徽省學科建設重大項目 高峰學科Ⅲ類 |
19 | 中藥學 | 安徽省重點學科（B類） 安徽省學科建設重大項目 安徽省“國內(nèi)一流學科”（B類） 高峰學科Ⅱ類 |
20 | 中醫(yī)內(nèi)科學 | 安徽省重點學科（B類） |
21 | 針灸推拿學 | 安徽省重點學科（B類） |
22 | 中醫(yī)基礎理論 | 安徽省重點學科（B類） |
23 | 中醫(yī)婦科學 | 安徽省重點學科（B類） |
24 | 中西醫(yī)結(jié)合臨床 | 安徽省重點學科（B類） |
25 | 中西醫(yī)結(jié)合基礎 | 安徽省重點學科（B類） |
26 | 中醫(yī)診斷學 | 安徽省重點學科（B類） |
27 | 中藥藥理學 | 安徽省重點學科（B類） |
28 | 藥劑學 | 安徽省重點學科（B類） |
29 | 方劑學 | 安徽省重點學科（B類） |
30 | 中醫(yī)外科學 | 安徽省重點學科（B類） |
31 | 中醫(yī)臨床基礎 | 校級重點支持學科 |
32 | 微生物與生化藥學 | 校級重點支持學科 |
33 | 藥物化學 | 校級重點支持學科 |
34 | 公共管理 | 校級重點支持學科 |
35 | 生藥學 | 校級重點支持學科 |
36 | 藥物分析學 | 校級重點支持學科 |
37 | 馬克思主義理論 | 校級重點支持學科 |
38 | 藥理學 | 校級重點支持學科 |
39 | 護理學 | 校級重點支持學科 |
40 | 中醫(yī)康復學 | 校級重點支持學科 |
以下是安徽中醫(yī)藥大學第四輪學科評估結(jié)果排名情況，由于第五輪還未公布，這也是最新評估結(jié)果。
| 序號 | 學校代碼 | 學校名稱 | 一級學科代碼 | 一級學科名稱 | 評選結(jié)果 |
| 1 | 10369 | 安徽中醫(yī)藥大學 | 1005 | 中醫(yī)學 | B- |
| 2 | 10369 | 安徽中醫(yī)藥大學 | 1008 | 中藥學 | B- |
| 3 | 10369 | 安徽中醫(yī)藥大學 | 1006 | 中西醫(yī)結(jié)合 | C+ |
| 4 | 10369 | 安徽中醫(yī)藥大學 | 1007 | 藥學 | C- |
安徽中醫(yī)藥大學位于安徽省合肥市，入選中西部高?；A能力（二期）建設項目，是安徽省高等教育振興規(guī)劃“地方特色高水平大學建設”計劃高校、安徽省高峰學科建設計劃支持高校。
安徽中醫(yī)藥大學創(chuàng)建于1959年，其前身是創(chuàng)建于1952年的安徽省中醫(yī)藥培訓班（學校）。1959年，安徽省政府正式批準成立安徽中醫(yī)學院。1970年，安徽中醫(yī)學院并入安徽醫(yī)學院。1975年，教育部批準安徽中醫(yī)學院復課。2000年，安徽醫(yī)學院并入安徽中醫(yī)學院。2011年，省政府批準在安徽中醫(yī)學院基礎上組建安徽省中醫(yī)學院。2013年，教育部同意安徽中醫(yī)學院更名為安徽中醫(yī)藥大學。
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